Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MCPH1Q8NEM0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCPH1Q8NEM0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCPH1Q8NEM0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms