Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM35BQ8NCS4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMEM35BQ8NCS4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMEM35BQ8NCS4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMEM35BQ8NCS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms