Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
NHLRC2Q8NBF2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHLRC2Q8NBF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms