Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9Z9

LMNTD1, Lamin tail domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD1Q8N9Z9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LMNTD1Q8N9Z9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LMNTD1Q8N9Z9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LMNTD1Q8N9Z9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMNTD1Q8N9Z9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms