Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8Q8

COX18, Mitochondrial inner membrane protein COX18, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX18Q8N8Q8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COX18Q8N8Q8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX18Q8N8Q8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX18Q8N8Q8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX18Q8N8Q8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX18Q8N8Q8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COX18Q8N8Q8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COX18Q8N8Q8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COX18Q8N8Q8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COX18Q8N8Q8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms