Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6S4

ANKRD13C, Ankyrin repeat domain-containing protein 13C, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD13CQ8N6S4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ANKRD13CQ8N6S4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ANKRD13CQ8N6S4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ANKRD13CQ8N6S4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ANKRD13CQ8N6S4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms