Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2E2

VWDE, von Willebrand factor D and EGF domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWDEQ8N2E2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
VWDEQ8N2E2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
VWDEQ8N2E2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
VWDEQ8N2E2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.28■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
VWDEQ8N2E2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
VWDEQ8N2E2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms