Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC13Q8IYE1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC13Q8IYE1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC13Q8IYE1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC13Q8IYE1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms