Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NELFCDQ8IXH7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NELFCDQ8IXH7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NELFCDQ8IXH7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NELFCDQ8IXH7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NELFCDQ8IXH7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NELFCDQ8IXH7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NELFCDQ8IXH7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
NELFCDQ8IXH7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms