Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPAS3Q8IXF0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NPAS3Q8IXF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NPAS3Q8IXF0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NPAS3Q8IXF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms