Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV01

SYT12, Synaptotagmin-12, humanhuman

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT12Q8IV01 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT12Q8IV01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SYT12Q8IV01 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SYT12Q8IV01 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SYT12Q8IV01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms