Protein–RNA interactions for Protein: Q86YI8

PHF13, PHD finger protein 13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF13Q86YI8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF13Q86YI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF13Q86YI8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF13Q86YI8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF13Q86YI8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF13Q86YI8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PHF13Q86YI8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PHF13Q86YI8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PHF13Q86YI8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PHF13Q86YI8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms