Protein–RNA interactions for Protein: Q86Y13

DZIP3, E3 ubiquitin-protein ligase DZIP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DZIP3Q86Y13 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
DZIP3Q86Y13 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
DZIP3Q86Y13 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
DZIP3Q86Y13 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
DZIP3Q86Y13 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
DZIP3Q86Y13 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms