Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ALYREFQ86V81 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ALYREFQ86V81 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ALYREFQ86V81 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms