Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT6

NLRX1, NLR family member X1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRX1Q86UT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NLRX1Q86UT6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NLRX1Q86UT6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NLRX1Q86UT6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NLRX1Q86UT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms