Protein–RNA interactions for Protein: Q86U37

LINC01551, Uncharacterized protein encoded by LINC01551, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01551Q86U37 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01551Q86U37 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01551Q86U37 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01551Q86U37 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
LINC01551Q86U37 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
LINC01551Q86U37 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
LINC01551Q86U37 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
LINC01551Q86U37 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms