Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ZNF554Q86TJ5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF554Q86TJ5 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF554Q86TJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms