Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNX20Q7Z614 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SNX20Q7Z614 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SNX20Q7Z614 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX20Q7Z614 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms