Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGC8

CHST3, Carbohydrate sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST3Q7LGC8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CHST3Q7LGC8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CHST3Q7LGC8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CHST3Q7LGC8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CHST3Q7LGC8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CHST3Q7LGC8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms