Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SV2AQ7L0J3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SV2AQ7L0J3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SV2AQ7L0J3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SV2AQ7L0J3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms