Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CREB3L2Q70SY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L2Q70SY1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3L2Q70SY1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CREB3L2Q70SY1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CREB3L2Q70SY1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L2Q70SY1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L2Q70SY1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L2Q70SY1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CREB3L2Q70SY1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms