Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWH5

NEK10, Serine/threonine-protein kinase Nek10, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK10Q6ZWH5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NEK10Q6ZWH5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NEK10Q6ZWH5 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEK10Q6ZWH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEK10Q6ZWH5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms