Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYP26C1Q6V0L0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYP26C1Q6V0L0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYP26C1Q6V0L0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CYP26C1Q6V0L0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP26C1Q6V0L0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms