Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CASP12Q6UXS9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASP12Q6UXS9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CASP12Q6UXS9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CASP12Q6UXS9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms