Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SMARCD3Q6STE5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCD3Q6STE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMARCD3Q6STE5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms