Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4Q7

CNNM4, Metal transporter CNNM4, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4Q6P4Q7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CNNM4Q6P4Q7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNNM4Q6P4Q7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CNNM4Q6P4Q7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CNNM4Q6P4Q7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms