Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3S6

FBXO42, F-box only protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO42Q6P3S6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FBXO42Q6P3S6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FBXO42Q6P3S6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FBXO42Q6P3S6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms