Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NEPROQ6NW34 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NEPROQ6NW34 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NEPROQ6NW34 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NEPROQ6NW34 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.8 ms