Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HMBOX1Q6NT76 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HMBOX1Q6NT76 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HMBOX1Q6NT76 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HMBOX1Q6NT76 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms