Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ22

RAB12, Ras-related protein Rab-12, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB12Q6IQ22 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB12Q6IQ22 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RAB12Q6IQ22 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
RAB12Q6IQ22 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RAB12Q6IQ22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms