Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CENPPQ6IPU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CENPPQ6IPU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CENPPQ6IPU0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CENPPQ6IPU0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms