Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPT2

FAM71E1, Protein FAM71E1, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E1Q6IPT2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FAM71E1Q6IPT2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FAM71E1Q6IPT2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FAM71E1Q6IPT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM71E1Q6IPT2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms