Protein–RNA interactions for Protein: Q63HM2

PCNX4, Pecanex-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4Q63HM2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCNX4Q63HM2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCNX4Q63HM2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCNX4Q63HM2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCNX4Q63HM2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCNX4Q63HM2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms