Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHEQ5VZ18 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SHEQ5VZ18 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SHEQ5VZ18 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms