Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWP2

FAM46C, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46CQ5VWP2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM46CQ5VWP2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FAM46CQ5VWP2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM46CQ5VWP2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM46CQ5VWP2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms