Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FAM208BQ5VWN6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM208BQ5VWN6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FAM208BQ5VWN6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM208BQ5VWN6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM208BQ5VWN6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
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