Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FNDC7Q5VTL7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FNDC7Q5VTL7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FNDC7Q5VTL7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FNDC7Q5VTL7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms