Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5VSD8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5VSD8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Q5VSD8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Q5VSD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5VSD8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5VSD8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5VSD8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5VSD8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5VSD8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Q5VSD8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Q5VSD8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q5VSD8 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q5VSD8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Q5VSD8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Q5VSD8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Q5VSD8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Q5VSD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Q5VSD8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Q5VSD8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q5VSD8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q5VSD8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q5VSD8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q5VSD8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q5VSD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q5VSD8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Q5VSD8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q5VSD8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Q5VSD8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q5VSD8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q5VSD8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q5VSD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms