Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5M9

CCNJ, Cyclin-J, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNJQ5T5M9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCNJQ5T5M9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCNJQ5T5M9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCNJQ5T5M9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNJQ5T5M9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms