Protein–RNA interactions for Protein: Q5T1Q4

SLC35F1, Solute carrier family 35 member F1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35F1Q5T1Q4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC35F1Q5T1Q4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC35F1Q5T1Q4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC35F1Q5T1Q4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms