Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ70

SPDYA, Speedy protein A, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPDYAQ5MJ70 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SPDYAQ5MJ70 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SPDYAQ5MJ70 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPDYAQ5MJ70 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPDYAQ5MJ70 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.9 ms