Protein–RNA interactions for Protein: Q5H9R7

PPP6R3, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R3Q5H9R7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPP6R3Q5H9R7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPP6R3Q5H9R7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPP6R3Q5H9R7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPP6R3Q5H9R7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms