Protein–RNA interactions for Protein: Q56A73

SPIN4, Spindlin-4, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN4Q56A73 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPIN4Q56A73 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPIN4Q56A73 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SPIN4Q56A73 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms