Protein–RNA interactions for Protein: Q49AR2

C5orf22, UPF0489 protein C5orf22, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf22Q49AR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf22Q49AR2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf22Q49AR2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf22Q49AR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf22Q49AR2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf22Q49AR2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
C5orf22Q49AR2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C5orf22Q49AR2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C5orf22Q49AR2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms