Protein–RNA interactions for Protein: Q2Y0W8

SLC4A8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A8Q2Y0W8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A8Q2Y0W8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A8Q2Y0W8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC4A8Q2Y0W8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
SLC4A8Q2Y0W8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SLC4A8Q2Y0W8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SLC4A8Q2Y0W8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms