Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CSPP1Q1MSJ5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CSPP1Q1MSJ5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSPP1Q1MSJ5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSPP1Q1MSJ5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms