Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LONRF1Q17RB8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LONRF1Q17RB8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LONRF1Q17RB8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LONRF1Q17RB8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
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