Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PPP1R3AQ16821 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PPP1R3AQ16821 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PPP1R3AQ16821 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
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