Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

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Length 191 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
KCNMB1Q16558 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNMB1Q16558 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMB1Q16558 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMB1Q16558 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms