Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
LY6EQ16553 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
LY6EQ16553 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LY6EQ16553 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms